L’animal de compagnie de Paul Conyngham, le fondateur de la société australienne de conseil en IA, Rosie, une chienne, a été diagnostiquée d’un mastocytome malin. Le vétérinaire a estimé qu’il ne lui resterait que quelques mois. Sans aucune formation en biologie, lui, a utilisé ChatGPT, Gemini et Grok — ces trois IA qui se répartissent les tâches — pour repérer, à partir de 300 Go de données de génomes, des mutations-cibles, et concevoir la toute première vaccination personnalisée par ARNm contre le cancer dans le monde. Trois mois plus tard, la tumeur de la chienne a diminué de 75 %. Le processus présenté dans cet article provient de l’intégralité du récit publié par Paul Conyngham sur X.
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Table des matières de l’article
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- Données génomiques de 300 Go
- Thérapie en trois étapes
- Il y a une tumeur qui ne bouge pas
Un après-midi de mai 2024, Paul Conyngham a emmené Rosie dans un cabinet vétérinaire à Sydney. En sortant, il tenait une feuille de diagnostic.
Mastocytome malin, selon le vétérinaire, il ne lui restait que quelques mois.
Rosie est un chien croisé de huit ans, type Staffordshire bull terrier et bouledogue, avec qui Conyngham a partagé plus de la moitié de sa vie. Conyngham est lui-même le fondateur d’une société australienne de conseil en IA : il programme, fait de l’analyse de données et aide les entreprises à intégrer des outils d’IA.
La biologie moléculaire est très loin de son domaine. Il ne sait pas ce qu’est le gène c-KIT, ne sait pas comment fabriquer un vaccin à ARNm, et même il n’est pas sûr que le chien puisse recevoir une immunothérapie.
Mais il sait comment poser des questions : il ouvre ChatGPT et commence à en chercher.
Données génomiques de 300 Go
La première recommandation de ChatGPT consiste à s’orienter vers l’immunothérapie, et à le diriger vers le professeur Martin Smith du centre de génomique Ramaciotti de l’Université de Nouvelle-Galles du Sud (UNSW), ainsi que vers l’équipe de l’Institut Garvan. Conyngham les contacte.
L’institut accepte de prendre en charge ce travail de « sauver la chienne ». Dès le départ, il s’agit de faire le séquençage de Rosie : l’équipe réalise un séquençage du génome entier et un séquençage de l’ARN, ce qui produit environ 300 Go de données brutes. La plupart des gens, en voyant ce chiffre, éteindraient directement l’ordinateur, mais le propriétaire, Conyngham, ne le fait pas. Il déverse les données dans ChatGPT, lui demandant de concevoir un processus d’analyse bio-informatique.
Ensuite, grâce à AlphaFold 2 (la technologie récompensée par le prix Nobel de chimie 2024), il modélise la structure tridimensionnelle des protéines mutées. Dans la comparaison croisée entre les données d’ADN et d’ARN, il cible la mutation du gène c-KIT et筛e 7 nouveaux sites antigéniques.
À ce stade, ChatGPT passe le relais à la prochaine IA.
Gemini Pro 2 prend la deuxième étape : il assemble les 7 cibles en une séquence de vaccin mult-épitope. Grok 3 passe la dernière étape en vérifiant la stabilité structurelle. Plus tard, Conyngham avouera que la configuration finale du vaccin vient en réalité des conceptions de Grok, et non de ChatGPT, comme largement rapporté à l’extérieur.
Un homme qui ne connaît pas la biologie, avec trois fenêtres de chat, réalise en une boucle le travail préalable d’un laboratoire.
Thérapie en trois étapes
Il ne suffit pas de faire seulement des injections de vaccin. Avec l’aide de l’IA, Conyngham conçoit une thérapie en trois volets : trois médicaments, mais chacun contre une « bataille » différente.
- Le vaccin à ARNm entraîne le système immunitaire de Rosie à reconnaître les cellules cancéreuses, afin que les cellules T apprennent à cibler ces 7 nouveaux antigènes.
- Un inhibiteur de tyrosine kinase (TKI) bloque la voie de signalisation entraînée par la mutation de c-KIT, empêchant la prolifération des cellules cancéreuses et la néoangiogenèse.
- Un inhibiteur de checkpoint PD-1 démonte le mécanisme de camouflage des cellules cancéreuses, permettant aux cellules T comprimées de reprendre le feu.
Ces termes spécialisés sont vraiment difficiles, n’est-ce pas ? En réalité, l’auteur n’a fait que suivre la manière dont Conyngham les décrit, car ces trois thérapies doivent être appliquées une étape après l’autre. Les médicaments immunosuppresseurs et le vaccin qui active l’immunité entreraient en contradiction s’ils se neutralisaient mutuellement. L’agencement dans le temps de l’administration a aussi été planifié par ChatGPT et Gemini.
Le vaccin est fabriqué par l’équipe du professeur Páll Thordarson de l’institut de recherche ARNm de l’UNSW. Il est finalisé en moins de deux mois, puis administré à la faculté de médecine vétérinaire de l’Université du Queensland, sous l’exécution de l’équipe du professeur Rachel Allavena.
En décembre 2025, Conyngham a conduit dix heures et a emmené Rosie à Gatton, dans le Queensland, pour recevoir la première injection.
Une semaine plus tard, la tumeur commence à diminuer de façon visible à l’œil nu.
En un mois, la tumeur de la taille d’une balle de tennis sur les articulations de la patte de Rosie a diminué de 75 %.
Une tumeur n’a pas réagi
Trois mois après la vaccination, Rosie est emmenée chez le médecin pour une évaluation complète. Deux tumeurs sur sa patte ont manifestement rétréci, mais une tumeur sur la région des hanches n’a montré aucune réaction.
L’équipe médicale l’a retirée chirurgicalement et l’a envoyée pour une analyse du génome. Les résultats préliminaires indiquent que les caractéristiques de mutation de cette tumeur ne correspondent pas au cancer ciblé par la conception du vaccin.
Au sein du même chien, un cancer est entraîné par des mutations génétiques différentes.
Ce n’est pas une erreur de l’IA : c’est un problème inhérent au cancer lui-même.
L’hétérogénéité tumorale (tumor heterogeneity) est l’un des problèmes les plus épineux de la recherche sur le cancer chez l’être humain depuis des décennies. Dans le même cas, des tumeurs différentes chez le même patient peuvent porter des gènes mutés entraînant des mécanismes entièrement différents. Le vaccin à ARNm a touché avec précision la plupart des objectifs, mais le cancer n’a jamais été un seul adversaire. C’est plusieurs adversaires aux apparences similaires.
Dans un long texte sur X, Conyngham a écrit une phrase, qui a été partagée plusieurs milliers de fois :
L’IA m’a permis, seul, d’…
…d’avoir les capacités d’un institut de recherche entier.
Il dit que cela englobe la planification des processus, l’apprentissage autonome, le débogage technique, le montage des documents de demande, la conception du vaccin…
Paul Conyngham évalue aujourd’hui la façon de rendre cette démarche de « lutte contre le cancer avec l’IA » standardisée et scalable, et peut-être que, à l’avenir, « il n’y aura pas que cette une seule chienne sauvée ».
Mais après que l’affaire se soit répandue, des experts médicaux ont tout de même rappelé au grand public qu’il s’agit d’un cas unique, pas des résultats d’une étude contrôlée. Le rétrécissement des tumeurs pourrait être dû au vaccin ; il pourrait aussi être l’effet des TKI ; ou encore l’effet des inhibiteurs de checkpoint ; ou bien un résultat combiné des trois. Sans groupe témoin, on ne peut pas confirmer la causalité, et cela ne peut pas être généralisé à l’ensemble des animaux atteints de cancer.
Donc ce n’est pas une percée transformatrice du type « l’IA a guéri le cancer », du moins pas encore à l’heure actuelle.
C’est une histoire avec une pointe de miracle : celle d’un ingénieur un peu reclus dont la chienne allait mourir, et qui, acculé, a assemblé une voie avec les outils d’IA qu’il avait sous la main. Cette voie fonctionne pour la plupart ; à la fin, une petite portion ne fonctionne pas, et il continue d’essayer de trouver une solution.
Rosie est encore en vie.
